Статья

Елена Игоревна Терентьева, с.н.с., Ботанический сад Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Россия, 119991, Москва, Ленинские Горы, д.1, стр.12); e-mail: el.terenteva@mail.ru
Татьяна Ивановна Варлыгина, с.н.с., Ботанический сад Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Россия 119991, Москва, Ленинские Горы, д.1, стр.12); e-mail: tat-varlygina@yandex.ru
Галина Федоровна Дарман, с.н.с., Амурский филиал Ботанического сада института ДВО РАН (Россия, Амурская область, 675004, г. Благовещенск, 2-й км Игнатьевского шоссе, 8); e-mail: gfdarman@yandex.ru
Галина Викторовна Дегтярева, в.н.с., Ботанический сад Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Россия, 119991, Москва, Ленинские Горы, д.1, стр.12); e-mail: degavi@mail.ru
Сергей Владимирович Ефимов, с.н.с., Ботанический сад Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Россия, 119991, Москва, Ленинские Горы, д.1, стр.12); e-mail: efimov-msu@yandex.ru
Тагир Халафович Самигуллин, с.н.с., НИИ физико-химической биологии им. А.Н. Белозерского Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Россия, 119992, Москва, Ленинские горы, д. 1, стр. 40); e-mail: tagrai@mail.ru

Terentieva E.I., Varlygina T.I., Darman G.F., Degtjareva G.V., Efimov S.V., Samigullin T.H. 2020. Revision and distribution of Liparis species (Orchidaceae) in Amur region (Russia) // Nature Conservation Research. Vol. 5(Suppl.1). P. 102–113. https://dx.doi.org/10.24189/ncr.2020.044

Electronic Supplement 1. Voucher information and GenBank accession numbers for taxa used in this study (Ссылка)
Electronic Supplement 2. Phylogenetic relationship in Liparis as revealed by maximum parsimony analysis (Ссылка)

В июле 2018 г. на территории государственного природного заповедника «Хинганский» и Муравьёвского парка устойчивого развития было проведено обследование популяций видов рода Liparis и первичное определение растений. Род Liparis остается одним из наиболее сложных в систематическом отношении в семействе Orchidaceae. Наблюдения в природе, изучение гербарных сборов и литературных данных показывают значительную внутривидовую вариабельность морфологических признаков. Поэтому для оценки видовой принадлежности представителей природных популяций были взяты фрагменты растений для молекулярно-филогенетических исследований. Всего в анализ было включено 110 образцов. В качестве молекулярного маркера были выбраны ядерные последовательности межгенного участка (ITS1–5.8S–ITS2) транскрибируемого рибосомного оперона. На молекулярно-филогенетическом дереве образцы из исследуемых популяций формируют отдельные хорошо поддержанные клады, что подтверждает их естественность. ITS последовательности анализируемых растений каждой клады имеют группоспецифические замены, которые маркируют их положение на филогенетическом дереве. Анализ морфологических признаков в совокупности с молекулярными данными позволил провести видовую идентификацию растений из рода Liparis. На территории Амурской области, согласно флористическим сводкам, были отмечены два вида (Liparis japonica и L. makinoana). Изучение популяций Liparis, найденных в природе, а также результаты анализа морфологических и молекулярных данных показали, что на исследуемой территории, кроме L. japonica и L. makinoana произрастает L. kumokiri, а также еще один вид, возможно, являющийся новым для науки. Уточнено распространение этих видов на обследованных нами территориях Амурской области, а также выявлены их новые местонахождения. Состояние ценопопуляций изученных видов в большинстве мест обитания было удовлетворительным. Отмечено хорошее плодоношение и наличие возобновления. В местах их произрастания могут быть заложены пробные площади для проведения мониторинговых исследований. Полученные данные о состоянии популяций редких видов будут использованы при подготовке новых изданий красных книг. На обследованных нами территориях Амурской области наличие Liparis makinoana не подтверждено молекулярными данными.

Красная книга, молекулярные исследования, морфологические признаки, особо охраняемая природная территория, редкие виды, состояние ценопопуляций, филогения

Поступила: 16.04.2020. Исправлена: 07.06.2020. Принята к опубликованию: 29.06.2020.

Cameron K.M. 2005. Leave it to the leaves: a molecular phylogenetic study of Malaxideae (Epidendroideae, Orchidaceae). American Journal of Botany 92(6): 1025–1032. DOI: 10.3732/ajb.92.6.1025
Chen S.C., Liu Z.J., Zhu G.H., Lang K.Y., Ji Z.H., Luo Y.B., Jin X.H., Cribb P.J., Wood J.J., Gale S.W., Ormerod P., Vermeulen J.J., Wood H.P., Clayton D., Bell A. 2009. Orchidaceae. In: Z.Y. Wu, P.H. Raven, D. Hong (Eds.). Flora of China. St. Louis: Science Press, Beijing et Missouri Botanical Garden Press. Vol. 25. P. 211–235.
Cheng T., Xu C., Lei L., Li C., Zhang Y., Zhou S. 2016. Barcoding the kingdom Plantae: New PCR primers for ITS regions of plants with improved universality and specificity. Molecular Ecology Resources 16(1): 138–149. DOI: 10.1111/1755-0998.12438
Darman G.F. 2015. Flora of the Muravyevskiy Natural Park. Scholarly Notes of Transbaikal State University 60(1): 11–16. [In Russian]
Dressler R.L. 1981. The orchids: natural history and classification. Cambridge, Massachusetts: Harvard University Press. 356 p.
Dressler R.L. 1993. Phylogeny and classification of the orchid family. Portland: Cambridge University Press. 314 p.
Edgar R.C. 2004. MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput. Nucleic Acids Research 32(5): 1792–1797. DOI: 10.1093/nar/gkh340
Efimov P.G. 2010. The genus Liparis (Orchidaceae) in Russia. Botanicheskii Zhurnal 95(10): 1458–1480. [In Russian]
Felsenstein J. 1985. Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap. Evolution 39(4): 783–791. DOI: 10.1111/j.1558-5646.1985.tb00420.x
Gap S.O., Mi Y.C., Sun G.C., Myong G.C. 2001. Contrasting breeding systems Liparis kumokiri and L. makinoana (Orchidaceae). Annales Botanici Fennici 38(4): 281–284.
Hall T.A. 1999. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symposium 41: 95–98.
Kim S.N., Kim Y.S. 1986. Morphological and cytological study on genus Liparis in Korea. Korean Journal of Plant Taxonomy 16(1): 59–88. DOI: 10.1007/s12374-010-9104-0
Kudrin S.G., Yakubov V.V. 2013. Illustrated Flora of the Khingan State Nature Reserve (Amur region): Vascular plants. Arkhara: Khingan State Nature Reserve. 335 p. [In Russian]
Lee C.S., Tsutsumi C., Yukawa T., Lee N.S. 2010. Two New Species of the Genus Liparis (Orchidaceae) from Korea Based on Morphological and Molecular Data. Journal of Plant Biology 53(3): 190–200. DOI: 10.1007/s12374-010-9104-0
Li L., Yan H. 2013. A remarkable new species of Liparis (Orchidaceae) from China and its phylogenetic implications. PLoS ONE 8(11): e78112. DOI: 10.1371/journal.pone.0078112
Maekawa F. 1971. The wild orchids of Japan in colour. Tokyo: Seibundo Shinkousha. 495 p. [In Japanese]
Miskina L.V. 1971. Landscape complexes of the Arkhara Lowland and south-western spurs of the Small Khingan and prospects for their economic development. PhD Thesis. Khabarovsk. 248 p. [In Russian]
Nevskiy S.A. 1935. Genus Liparis L. C. Rich. In: Flora of the USSR. Vol. 4. Leningrad: AS USSR. P. 601–604. [In Russian]
Ohwi J. 1965. Flora of Japan. Washington: Square Press. 1067 p.
Rabotnov T.A. 1950. Problems of investigating the composition of populations for the phytocoenology purpose. In: Problems of Botany 1: 465–483. [In Russian]
Red Data Book of the Amur region: Rare and Endangered Species of Animal, Plants and Fungi. Blagoveshchensk: Publishing House of the Far Eastern State Agrarian University, 2019. 501 p. [In Russian]
Red Data Book of the Russian Federation (plants and fungi). Moscow: KMK Scientific Press Ltd., 2008. 855 p. [In Russian]
Ronquist F., Teslenko M., van der Mark P., Ayres D.L., Darling A., Höhna S., Larget B., Liu L., Suchard M.A., Huelsenbeck J.P. 2012. MrBayes 3.2: efficient Bayesian phylogenetic inference and model choice across a large model space. Systematic Biology 61(3): 539–542. DOI: 10.1093/sysbio/sys029
Shibneva I.V. 2004. Liparis kumokiri (Orchidaceae) in the Russian Far East. Botanicheskii Zhurnal 89(10): 1633–1636. [In Russian]
Shibneva I.V. 2007. Notes on the Liparis (Orchidaceae) species from the Primorsky Krai. In: Plants in the monsoon climate. Vladivostok. P. 264–268. [In Russian]
Shibneva I.V. 2008. Species of the genus Liparis (Orchidaceae) in the south of the mainland part of the Russian Far East. In: Fundamental and applied problems of botany in early XXI century. Petrozavodsk. P. 148–150. [In Russian]
Shibneva I.V. 2011. What are Liparis japonica (Miq) Maxim. and L. makinoana Schltr. (Orchidaceae) – notes of the botanist. In: Protection and cultivation of orchids. St. Petersburg. P. 287–289. [In Russian]
Starchenko V.M., Darman G.F. 2002. Flora of the Botanical Garden of the Amur Scientific Centre FEB RAS. In: Introduction Centres of the Russian Far East, Research Results. Vladivostok: Dalnauka. P. 161–173. [In Russian]
Su Y.Y., Meng Y., Shi Y., Tang G.D., Liu Z.J. 2014. Liparis funingensis (Orchidaceae; Epidendroideae; Malaxidae), a new species from Yunnan, China: Evidence from morphology and DNA. Phytotaxa 166(1): 85–93. DOI: 10.11646/phytotaxa.166.1.6
Su Y.Y, Huang Y.L., Chen L.J., Zhang P.W., Liu Z.J., Zhang G.Q. 2015. Liparis wenshanensis, a new orchid species from China: Evidence from morphological and molecular analyses. Phytotaxa 204 (4): 253–264. DOI: 10.11646/phytotaxa.204.4.2
Swofford D.L. 2003. PAUP*. Phylogenetic Analysis Using Parsimony (*and Other Methods): Version 4. Massachusetts: Sinauer Associates. 142 p.
Tatarenko I.V. 1996. Orchids of Russia: life forms, biology, conservation issues. Moscow: Argus. 207 p. [In Russian]
Terentieva E.I., Degtjareva G.V., Efimov S.V., Samigullin T.Kh., Varlygina T.I. 2016. The use of morphological and molecular methods to determine the species affiliation of plants of the genus Liparis (Orchidaceae) in the Kedrovaya Pad State Nature Reserve. In: Problems of Botany in Southern Siberia and Mongolia. Barnaul: Publishing House of the Altai State University. P. 131–136. [In Russian]
Terentieva E.I., Degtjareva G.V., Efimov S.V., Samigullin T.Kh., Varlygina T.I. 2018. Taxonomic revision of the Liparis (Orchidaceae) species distributed in the Primorsky Krai and the Sakhalin region on the basis of the analysis of morphological and molecular data. In: Problems of Botany in Southern Siberia and Mongolia. Barnaul: Publishing House of the Altai State University. P. 440–444. [In Russian]
Terentieva E.I., Degtjareva G.V. Efimov S.V., Varlygina T.I. 2019. Species delimitation in Liparis (Orchidaceae) on the basis of the morphological and molecular data in the Muravyevskiy Park of the Sustainable Development. In: Problems of Botany in Southern Siberia and Mongolia. Barnaul: Publishing House of the Altai State University. P. 435–440. [In Russian]
Tsutsumi C. Yukawa T. 2008. Taxonomic status of Liparis japonica and L. makinoana (Orchidaceae); preliminary report. Bulletin of the National Museum of Nature and Science, Series B 34(2): 89–94.
Tsutsumi C., Yukawa T., Lee N.S., Lee C.S., Kato M. 2007. Phylogeny and comparative seed morphology of epiphytic and terrestrial species of Liparis (Orchidaceae) in Japan. Journal of Plant Research 120(3): 405–412. DOI: 10.1007/s10265-007-0077-0
Tsutsumi C., Yukawa T., Kato M. 2008a. Liparis purpureovittata (Orchidaceae) – a new species from Japan. Acta Phytotaxonomica et Geobotanica 59(1): 73–77. DOI: 10.18942/apg.KJ00004899890
Tsutsumi C., Yukawa T., Lee N.S., Lee C.S., Kato M. 2008b. A new species of Liparis from Japan and Korea. Acta Phytotaxonomica et Geobotanic 59(3): 211–218. DOI: 10.18942/apg.KJ00005124835
Vakhrameeva M.G., Varlygina T.I., Tatarenko I.V. 2014. Orchids of Russia: biology, ecology and conservation. Moscow: KMK Scientific Press Ltd. 437 p. [In Russian]
Valiejo-Roman C.M., Terentieva E.I., Samigullin T.H., Pimenov M.G. 2002. Relationships among genera in Saniculoideae and selected Apioideae (Umbelliferae) inferred from nrITS sequences. Taxon 51(1): 91–101. DOI: 10.2307/1554966
Varlygina T.I., Degtjareva G.V., Efimov S.V., Terentieva E.I. 2017. Population studies of the orchids in the Reserve Kedrovaya Pad. Biodiversity and Environment of Far East Reserves 1: 67–82. [In Russian]
Vyshin I.B. 1996. Orchids – Orchidaceae. In: Vascular plants of the Soviet Far East. St. Petersburg: Nauka. Vol. 8. P. 337–338. [In Russian]